留学时录指纹的主要原因包括：

防止身份盗用和造假：

通过采集指纹，可以更有效地识别和管理申请者的身份，防止非法分子利用伪造身份进入目标国家。

提高签证申请安全性：

生物识别信息有助于加快签证审核过程，并确保申请者的身份得到确认，从而提高签证申请的通过率。

加强入境管理：

留存指纹是对国民安全的一种保障，便于国家对外国人进行统一管理。

符合国际规定：

许多国家，包括加拿大、美国和日本，都要求入境外国人留存指纹和接受现场拍照，这是国际上通用的做法。

便于追踪和管理：

对于招收外国学生的教育机构，留存指纹信息有助于有效追踪和管理学生，例如在学生连续缺席课程或推迟上课时，院校需要向内政部报告。

综上所述，录指纹在留学过程中是一项重要的安全措施，旨在确保个人身份的真实性、提高安全性和便于管理。