鲁迅的日本留学经历可分为两个阶段，主要在以下地点进行：

一、东京阶段（1902年3月-1904年）

弘文学院

鲁迅于1902年3月抵达日本，先在弘文学院补习日语，为后续学习做准备。该学院是日本专门面向中国留学生的日语培训学校，由日本教育家嘉納治五郎于1902年创立。

- 重要活动：

在此期间，鲁迅发表了地质学著作，并结识了徐寿裳、周作人等挚友。

东京帝国大学医学院

1904年，鲁迅从弘文学院毕业后转入东京帝国大学医学院学习医学。

二、仙台阶段（1904年9月-1906年）

仙台医学专门学校

鲁迅于1904年9月进入仙台医学专门学校（现日本东北大学医学部），师从藤野严九郎。该学校是日本东北地区最早的医学教育机构，也是鲁迅成为首位中国留学生的地方。

- 重要转折：

在仙台期间，鲁迅目睹了中国留学生受到的歧视，结合“医者仁心”的信念，于1906年决定弃医从文。

三、补充说明

时间线：鲁迅1902年3月赴日，至1909年8月结束留学回国，共历时7年多。

影响：东京阶段侧重语言和基础科学学习，仙台阶段则通过医学教育培养其实践能力，两者共同促成了其文学创作和思想体系的形成。

以上信息综合自多个权威来源，可全面反映鲁迅的日本留学经历。